广西医科大学后勤处于2000年6月7日成立，由建校初期的庶务课及斋务室发展而来，后来更名为事务课、总务科、总务处。在不同的时期，其所设机构亦有所不同。2017年1月，按照学校工作的统一安排，后勤处与基建处合并为后勤基建处。
后勤基建处作为学校的一个行政职能部门，代表学校行使后勤基建管理、保障、服务的职能，下设处办公室、项目管理科、学生宿舍管理科、食堂管理科、水电能源管理科、物业管理科6个科室，挂靠危旧房改造项目办公室。主要对后勤基建工作进行宏观规划，监督管理、协调检查，对后勤基建项目工作进行论证、申报并组织工程的实施，对学校教学科研、日常生活后勤基建做好保障工作。
在学校党委的正确领导下，后勤基建处本着“党建引领，齐抓共管，凝聚人心，服务师生”的工作理念，紧紧围绕“态度转变，作风改进，效率提高，服务质量，流程跟踪”的工作目标，对内完善管理机制，对外提升服务质量，从思想认识，责任落实，制度执行，宣传引导四个抓手，抓好干部作风建设，落实党建工作责任制，抓好制度建设，健全管理制度，加强阵地建设，提升党建活力。在师生人数逐年增加、新建教学行政用房不断投入使用的情况下，克服人员结构老化和数量不足等困难，坚持服务过程中的创新和突破，不断提升后勤保障服务管理水平，较好地完成了各项后勤保障工作。
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